Довольно часто пещера представляет из себя серию параллельных русел, из которых одно обводнено, а остальные сухие. Последние находятся на разных гипсометрических уровнях и соединены между собой забитыми обломочным материалом щелями, узкими ходами.
Многоэтажный карст образуется при быстром смещении базиса эрозии при тектонических движениях массива. Если базис опустился, профиль равновесия становится неустойчивым, резко возрастает эрозия дна полости и вода быстро пропиливает узкую щель до тех пор, пока не достигнет нового устойчивого профиля равновесия.
Если же базис эрозии, наоборот, поднялся, то нижний этаж будет погребен обломочным материалом (погребенный карст), а новый профиль равновесия будет выработан выше.
В Бельгии бурением вскрыты погребенные полости на глубине 1 км. ниже уровня моря.
Горизонтальная конфигурация пещеры контролируется следующими факторами:
1.Субвертикальные тектонические разломы, часто это система параллельных разломов.
2.Трещины напластования. Если породы лежат наклонно, то полость закладывается преимущественно в плоскости таких трещин. Причем так, чтобы русло не поднималось вверх. То есть в диапазоне 180 градусов. Если, например, азимут падения слоев 95, то полость будет залегать по горизонтальному азимуту от 5 до 185.
3.Уровень грунтовых вод. Зеркало грунтовых вод далеко не всегда имеет строго горизонтальную конфигурацию. Обычно поверхность понижается вблизи долин, других понижений рельефа. Точно так же, как вода стекает вниз по склону, так же подземная река будет стекать в сторону понижения зеркала грунтовых вод. Именно так и будет направлена пещера.
4.Модуль трещиноватости. То есть степень ослабленности пород трещинами. Если между двумя монолитными блоками залегает тонкий слой рыхлых пород, то с большой вероятностью можно сказать, что пещера будет тяготеть к этим ослабленным породам.
5. Равнинные реки, имеющие долины в несколько километров шириной, обычно меандрируют (петляют). Меандрирование и широкие долины характерны для водотоков, приближающихся к базису эрозии. Подземные реки не могут выработать широкой долины, но и они могут образовывать небольшие петлеобразные изгибы в нижних частях водоносной системы.